Le poumon ne faisait pas partie des sites du corps humain alors explorés dans ce projet étant donné qu’il était encore considéré comme un organe stérile. L’avènement des techniques de séquençage à haut débit a permis de mettre en évidence l’existence d’un microbiote respiratoire composé de nombreux micro-organismes non détectables par des méthodes de cultures bactériennes conventionnelles.